Структура

В структуре Научного центра функционируют:

1.Отделы

2.Лаборатории

3.Группы

4.Центр повышения квалификации

5.Производственные подразделения

6.Опытно-экспериментальные хлопкозаводы

Отделы подразделяются на научно-производственные  и административно-технические  (общее количество  — 9):

Научно-производственные отделы

• Отдел стандартизации и метрологии
• Отдел по внедрению  современной техники и технологии
•  Отдел проектирования
• Отдел  научно-технической и патентной информации

Административно-технические отделы

• Отдел кадров
• Производственно-экономический отдел
• Отдел бизнес планирования и экономического анализа
• Отдел бухучета и финансирования
• Отдел технического и обслуживающего персонала

Научно-исследовательские лаборатории (общее количество – 7):

• ЛАБОРАТОРИЯ   ТЕПЛОМАССОБМЕНА
• ЛАБОРАТОРИЯ   ОЧИСТКИ   ХЛОПКА-СЫРЦА
• ЛАБОРАТОРИЯ ДЖИНИРОВАНИЯ, ВОЛОКНООЧИСТКИ и ЛИНТЕРОВАНИЯ
• ЛАБОРАТОРИЯ АВТОМАТИЗАЦИИ
• ЛАБОРАТОРИЯ ПОДГОТОВКИ ПОСЕВНЫХ СЕМЯН
• ЛАБОРАТОРИЯ СЫРЬЯ и НОВЫХ СОРТОВ
• ЛАБОРАТОРИЯ ЭКОНОМИКИ

Группы(общее количество – 2)

• Группа испытания хлопка
• Эталонная группа

Системный блок:

• Ученый совет
• Технический комитет «Хлопок»
• Лицензированный полиграфический участок
• Видеостудия по производству фильмов отраслевой тематики
• Участок   по изготовлению хлопковой эталонной продукции и ГСО
• Испытательный участок для  внутриотраслевых арбитражных испытаний

Связь с профильными организациями:

• Комитет по координации развития науки и технологий при КМ Республики Узбекистан
• Центр геномики и биоинформатики
• ООО «Пахтаджин КБ»
• Госкомиссия Республиканского экспертного совета по техническим культурам
• Институт механики  и сейсмостойкости сооружений АН РУз
• Институт электроники АН РУз
• Ташкентский институт текстильной и легкой промышленности
• УЦ «Сифат»
• Наманганский инженерно-экономический институт
• НПО «Академприбор»
• НПФ «Селва»
• ОАО «Узенгилсаноатлойиха»
• ООО «Мегаваттэнерго»